院系设置
建筑学院，机械工程学院，能源与环境学院，信息科学与工程学院，土木工程学院，电子科学与工程学院，数学学院，自动化学院，计算机科学与工程学院，物理学院，生物科学与医学工程学院，材料科学与工程学院，人文学院，经济管理学院，电气工程学院，外国语学院，体育系，化学化工学院，交通学院，仪器科学与工程学院，艺术学院，法学院，医学院，公共卫生学院，吴健雄学院，海外教育学院，软件学院，微电子学院，马克思主义学院，网络空间安全学院，人工智能学院，东南大学雷恩研究生学院，东南大学—蒙纳士大学苏州联合研究生院
